采用化學反應檢測ATP，用拭子采集標本。拭子被緩沖液浸濕，這樣有助于從干燥或濕潤的表面提取生物物質。拭子也含有一種可以沖破生物膜的試劑，使其下可能存在的生物體暴露出來。
標本采集后，拭子應浸泡在能將細胞內ATP釋放出來的溶劑中。而后細胞內部釋放出的ATP、以及拭子從設備表面抹取的ATP再和液體試劑一起反應。
液體試劑含有兩種螢火蟲酶——-熒光素和熒光素酶，蟲熒光素和蟲熒光素酶在ATP存在的條件下會發光。發出的光可由熒光儀進行檢測。檢測的發光量與ATP的總量成正比。數值越高，表明ATP的量越多，也就意味著表面的殘留物越多。
Clean-TraceATPLM1熒光儀的優勢：
制樣簡單，試樣多數不需經過化學處理就可分析，且固體、液體試樣均可直接分析。
分析速度快。雖然測定用時與測定精密度有關，但一般都很短，2～5分鐘就可以測完樣品中的全部待測元素。
多元素同時檢出能力。可同時檢測一個樣品中的多種元素。一個樣品一經激發，樣品中各元素都各自發射出其特征譜線，可以進行分別檢測而同時測定多種元素。
敏感度高，選擇性好。熒光分析的靈敏度要比吸收光譜測量高2-3個數量級。
非破壞分析。在測定中不會引起化學狀態的改變，也不會出現試樣飛散現象。同一試樣可反復多次測量，結果重現性好。